Ga Yên Bái là một trong những điểm bị ngập sâu nhất trên tuyến đường sắt Hà Nội - Lào Cai. Tại trung tâm điều hành chạy tàu có thời điểm nước ngập sâu, toàn bộ thiết phục vụ công tác chạy tàu đã chìm sâu trong nước.

Chủ động ứng phó với mưa lũ, cán bộ kỹ thuật tại ga Yên Bái đã kịp thời tháo dỡ các thiết bị điện tử phục vụ chyạ tàu. Thiệt hại được giảm thiểu nhưng để khôi phục lại hoạt động như ban đầu cũng mất nhiều thời gian. 

Ngoài các khu ga bị ngập sâu trên toàn tuyến có tới gần 100 điểm bị sạt trượt. Một trong những điểm bị nặng nhất là tại địa bàn huyện Hạ Hòa, Phú Thọ. Cả đoạn đường dài gần 1km bị nước lũ cuốn trôi đá nền đường. Ngay sau khi nước rút đơn vị quản lý đường đã nhanh chóng triển khai phương án khắc phục tuy nhiên cũng có những khó khăn để đẩy nhanh tiến độ.

Khối lượng cần khắc phục lớn để rút ngắn thời giant hi công các đơn vị trong ngành đường sắt đã chủ động khắc phục những đoạn tuyến hư hỏng nhẹ để có thể sử dụng vận chuyển vật liệu đến những điểm hư hỏng lớn. Vật tư, thiết bị phục vụ thi công cũng đã có phương án dự phòng nên tiến độ khắc phục sửa chữa không quá bị ảnh hưởng.

Theo dự kiến, công tác khắc phục sửa chữa trên tuyến đường sắt Hà Nội - Lào Cai sẽ hoàn thành để có thể thông tàu vào trước 10h ngày 15/10. Tuy nhiên tốc độ khai thác chạy tàu vẫn sẽ bị ảnh hưởng nhất là tại các khu ga bởi hệ thống thông tin tín hiệu sẽ cần nhiều thời gian hơn để khôi phục lại hoạt động như ban đầu.